روحانی همچنین در نامهای به وزارت نیرو «قانون موافقتنامه همکاری بین دولت جمهوری اسلامی ایران و دولت جمهوری آذربایجان در زمینه ادامه ساخت، بهره برداری و استفاده از منابع آب و انرژی سدها و نیروگاههای برق آبی خداآفرین و قیزقلعه سی بر روی رودخانه ارس» را برای اجرا ابلاغ کرد.
این دو قانون، هفدهم آذرماه ۹۵ در مجلس شورای اسلامی تصویب و در هشتم دیماه نیز از سوی شورای نگهبان تایید شده بودند.